На данный момент испанец является главой отдела международных отношений и скаутинга стамбульского «Галатасарая» с лета прошлого года. В ближайшее время Фрэнсис Кагигао собирается подписать контракт со столичным клубом «Спартак», став его спортивным директором.
Ранее он был скаутом в лондонском «Арсенале», а также занимал пост технического директора Федерации футбола Чили.