Слишкович работал в «Спартаке» с лета 2022 года, он входил в тренерский штаб Гильермо Абаскаля. После увольнения Абаскаля Слишкович стал и.о. главного тренера красно-белых. Под его руководством спартаковцы провели 9 матчей, в которых одержали 5 побед, 3 раза сыграли вничью и потерпели 1 поражение. В РПЛ «Спартак» ни разу не проиграл, единственный проигрыш — в финале Пути регионов от «Балтики» (0:1).
Сезон-2023/24 «Спартак» завершил на 5-м месте в РПЛ, набрав в 30-ти матчах 50 очков.
С сезона-2024/25 «Спартак» будет возглавлять сербский специалист Деян Станкович, с которым подписан контракт на два года.