Белорусский специалист возглавил ЦСКА в декабре 2016 года, сменив у руля команды Леонида Слуцкого. Под руководством Гончаренко армейцы два раза подряд заняли второе место в чемпионате России. В сезоне-2017/18 столичная команда дошла до четвертьфинала Лиги Европы, где уступила лондонскому «Арсеналу».
Ранее Гончаренко в России работал с краснодарской «Кубанью», екатеринбургским «Уралом», «Уфой». С 2007 по 2013 год он возглавлял борисовский БАТЭ, который привел к шести титулам чемпиона Белоруссии.
ЦСКА в следующем сезоне выступит в групповом турнире Лиги чемпионов.