Ломбертс – воспитанник одного из лучших бельгийских клубов "Брюгге". Его профессиональная карьера началась в июле 2004 года в "Генте", где он играл на протяжении трех лет. Здорово проявив себя в составе молодежной сборной Бельгии, заинтересовал селекционеров "Зенита", и в итоге в июле 2007 года перешёл в питерскую команду. За полгода сумел доказать, что "Зенит" в нем не ошибся, став одним из лучших защитников чемпионата России (3-е место в списке 33 лучших). В 2008 году в матче с "Вильярреалом", отдавая голевой пас Павлу Погребняку, получил серьёзную травму колена. Тем не менее именно это действие Ломбертса по праву считается ключевым в розыгрыше Кубка УЕФА 2007/08, ставшем победным для "Зенита".