Помимо «Москвы», из второго квалификационного раунда не пробилось ни одной команды из бывших стран СНГ. Сложили оружие лиепайский «Металлург», грузинская «ВИТ-Джорджия» и даже самый крепкий из соискателей — «Днепр». Команда Олега Протасова проиграла на выезде новичку высшего швейцарского дивизиона «Беллинцоне» 1:2. На следующий день наставник «Днепра» Олег Протасов был отправлен в отставку. Исполнять его обязанности временно будет Владимир Бессонов.
Из остальных результатов стоит отметить очередной успех кипрских клубов — несмотря на то что соперниками двух команд из Никосии — АПОЭЛа и «Омонии» — были соответственно «Црвена Звезда» и АЕК, оба «карлика» пробились в третий раунд. В очередной раз удивил болгаро-бразилец Алекс Александров из «Черно море» — первый мяч в ворота «Маккаби» из Нетании он забил ударом с центра поля.
«Брондбю» (Дания) — «Хака» (Финляндия) — 2:0 (4:0)
- Голы: Мадсен, 31; Холмен, 40.
«Васлуй» (Румыния) — «Металлург» (Латвия) — 3:1 (2:0)
- Голы: Бурдуян, 4 (1:0); Кану, 6 (2:0); Н’Дой, 29 (3:0); Антонио Феррейра, 85 (3:1).
«Штурм» (Австрия) — «Цюрих» (Швейцария) — 1:1, по пенальти 3:5 (1:1)
- Голы: Абди, 5 (0:1); Хельцль, 11 (1:1).
«Жилина» (Словакия) — «Слован» (Чехия) — 2:1 (2:1)
- Голы: Белак, 81 (1:0); Йеж, 87 (2:0); Незмар, 90 (2:1).
«Бешикташ» (Турция) — «Широки Бриег» (Босния) — 4:0 (2:1)
- Голы: Угюр, 14; Озкан, 49; Бобо, 58; Телло, 85.
«Дебрецен» (Венгрия) — «Янг Бойз» (Швейцария) — 2:3 (1:4)
- Голы: Шнойвли, 32 (0:1); Ола, 41 (1:1); Регаццони, 56 (1:2); Япи-Япо, 67 (1:3); Омагбеми, 73 (2:3).
«Грассхопперс» (Швейцария) — «Лех» (Польша) — 0:0 (0:6). «Беллинцона» (Швейцария) — «Днепр» (Украина) — 2:1
- Голы: Гаши, 1 (1:0); Самодин, 9 (1:1); ла Рокка, 76 (2:1).
«Црвена Звезда» (Сербия) — АПОЭЛ (Кипр) — 3:3 в доп. время (2:2)
- Голы: Косовски, 54 (0:1); Пинто, 57 (0:2); Субашич, 77 (1:2); Мильяш, 85 (2:2); Мильяш, 103 (3:2); Мирославлевич, 117 (3:3).
«Дьер» (Венгрия) — «Штутгарт» (Германия) — 1:4 (1:2)
- Голы: Ланиг, 31 (0:1); Хитцльшпергер, 41 (0:2); Гомес, 55 (0:3); 60 (0:4); Байзат, 81 (1:4).
«Ренн» (Франция) — «Стабек» (Норвегия) — 2:0
- Голы: Леруа, 38, с пенальти; 80.
«Хайдук» (Хорватия) — «Депортиво» (Испания) — 0:2
- Голы: Рики, 42; Верду, 87, с пенальти.
«Сент-Патрикс» (Ирландия) — «Эльфсборг» (Швеция) — 2:1 (2:2)
- Голы: Ишизаки, 63 (0:1); Гэйвен, 86 (1:1); Куигли, 89 (2:1).
«Астон Вилла» (Англия) — «Хафнарфьордур» (Исландия) — 1:1 (1:4)
- Голы: Гарднер, 27 (1:0); Бьорнссон, 30 (1:1).
«Наполи» (Италия) — «Влажния» (Албания) — 5:0 (3:0)
- Голы: Ринаудо, 42; 55; Пия, 50; Лавесси, 80; Гамсик, 87